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가거도 패총은 우리나라 최서남단의 섬 가거도 북쪽 끝에 있는 등대의 서쪽 경사면에 있다.

1968년 서울대 인류학 조사팀에 의해 발견되었으며, 이후 2005년 국립광주박물관의 발굴조사를 통해 신석기시대 전기부터 말기
까지의 토기류, 석기류, 골각기류 등이 확인되었다.

육지와 멀리 떨어진 섬에 정착했던 신석기시대 사람들의 문화를 연구하는데 중요한 학술적 가치가 있다.